ГОСТ Р ИСО 21474-1-2021. Национальный стандарт Российской Федерации. Медицинские изделия для диагностики in vitro. Мультиплексные молекулярные методы для определения содержания нуклеиновых кислот. Часть 1. Терминология и общие требования к оценке качества нуклеиновых кислот

3 Термины и определения

 

В настоящем стандарте применены следующие термины с соответствующими определениями.

ИСО и МЭК ведут терминологические базы данных для использования в области стандартизации по следующим адресам:

- платформа онлайн-просмотра ИСО: http://www.iso.org/obp;

- Электропедия МЭК: http://www.electropedia./org.

3.1 точность (accuracy): Степень близости результатов испытаний или измерений к истинному значению измеряемой величины.

Примечание 1 - Термин "точность" применительно к совокупности результатов мультиплексного исследования включает совокупность случайной составляющей и общей систематической ошибки или компонента смещения (ИСО 3534-2:2006, 3.3.1).

 

[Руководство ИСО/МЭК 99:2007, 2.13, с изменениями - примечание 1, примечание 2 и примечание 3 удалены, добавлено новое примечание 1]

3.2 алгоритм (algorithm): Набор правил или вычислений, которые применяют к результатам исследования, чтобы получить результат для интерпретации или учета.

3.3 аллель (allele): <генетика> Любая из нескольких форм гена, ответственного за наследственную изменчивость.

Примечание 1 - Аллель также может быть определен как:

1) одна из альтернативных форм полиморфной последовательности ДНК, которая не обязательно относится к гену;

2) одна из альтернативных форм гена, которая может занимать данный локус.

 

3.4 соотношение аллелей (allelic ratio): Отношение конкретного аллеля (см. 3.3) к общему числу аллелей (см. 3.3) в популяции, обычно выраженное в виде дроби.

Примечание 1 - Например, если данный аллель (см. 3.3) составляет 40% от общего числа аллелей (см. 3.3), в данном локусе аллельное соотношение составляет 0,4.

Примечание 2 - Аллельное соотношение является синонимом частоты аллелей.

 

3.5 аналит (analyte): Компонент, представленный в названии измеряемой величины.

[ИСО 17511:2020, 3.1, с изменениями - пример удален]

3.6 химическая чистота (chemical purity): Степень загрязнения химическими веществами, влияющими на мультиплексный анализ.

Примечание 1 - Чистота нуклеиновой кислоты для ПЦР - отсутствие органических и белковых примесей, прошедших стадию экстракции, а также отсутствие контаминирующих нуклеиновых кислот.

 

3.7 метод ДНК-микрочипов (DNA microarray DNA chip): Твердый субстрат, на который напрямую или опосредованно наносится смесь проб ДНК, что позволяет исследовать большое количество биологического материала с использованием высокопроизводительных методов скрининга.

[ИСО 16578:2013, 3.3]

3.8 документированная процедура (documented procedure): Установленный способ осуществления деятельности или выполнения процесса, которые документируются, внедряются и поддерживаются в том числе участием в межлабораторных сличениях (см. 3.13).

3.9 метод оценки качества (evaluation method): Способ оценки качества для заданной нуклеиновой кислоты.

3.10 срок годности (expiry date expiration date): Верхний предел временного интервала, в течение которого при хранении материала в определенных условиях могут быть гарантированы его функциональные характеристики.

Примечание 1 - Сроки годности, приписанные реагентам (см. 3.16), калибраторам, контрольным материалам и другим компонентам, основаны на свойствах стабильности, определенных опытным путем.

 

[ИСО 18113-1:2009, 3.17, с изменениями - примечание 2 и примечание 3 удалены]

3.11 внешний стандарт измерения; стандартный образец (external measurement standard; reference standard): Материал или субстрат, подготовленный для проверки совместимости методов мультиплексного анализа, значения свойств которого определяются как опорное значение на основе совместной экспериментальной работы под руководством научной или технической группы.

Примечание 1 - Как правило, речь идет о мультиплексном молекулярном анализе.

Примечание 2 - Стандарт может быть использован в качестве альтернативы внешнему эталону измерений.

 

[ИСО 16578:2013, 3.9, с изменениями - добавлены примечание 1 и примечание 2]

3.12 предусмотренное применение; использование по назначению (intended use; intended purpose): Объективное намерение изготовителя изделия для диагностики in vitro в отношении применения продукта, процесса или услуги, отраженное в спецификациях, инструкциях и информации, предоставленной изготовителем изделия для диагностики in vitro.

[ИСО 18113-1:2009, 3.31, с изменениями - примечание 1 и примечание 2 удалены]

3.13 межлабораторное сличение <1> (interlaboratory comparison): Организация, выполнение и оценивание измерений или испытаний одного и того же или нескольких подобных образцов двумя или более лабораториями в соответствии с заранее установленными условиями.

--------------------------------

<1> В Российской Федерации наряду с данным термином применим термин "межлабораторные сравнительные испытания".

 

[ИСО/МЭК 17043:2010, 3.4]

3.14 устройство для in vitro диагностики; IVD устройство (in vitro diagnostic instrument; IVD instrument): Оборудование или прибор, предназначенные изготовителем для применения как медицинское изделие для диагностики in vitro (см. 3.15).

[ИСО 18113-1:2009, 3.26, с изменениями - примечание 1 исключено]

3.15 медицинское изделие для диагностики in vitro <2> (in vitro diagnostic product; in vitro diagnostic medical device; IVD medical device): Реагенты, инструменты и системы, предназначенные для использования в диагностике заболеваний или других состояний, включая определение состояния здоровья, с целью лечения или предотвращения заболевания или его последствий.

--------------------------------

<2> В ГОСТ Р ИСО 18113-1-2015 "Медицинские изделия для диагностики in vitro. Информация, предоставляемая изготовителем (маркировка). Часть 1. Термины, определения и общие требования" используется термин с определением: "медицинское изделие для диагностики in vitro (МИ IVD): Медицинское изделие, предназначенное изготовителем для применения при исследованиях in vitro образцов, взятых из тела человека единственно или главным образом для получения информации, которая может быть использована для целей диагностики, мониторинга или совместимости, включающее в себя реагенты, калибраторы, контрольные материалы, емкости для сбора и хранения проб и относящиеся к ним инструменты или приборы или другие предметы".

 

[21CFR809.3 Федерального закона США о продуктах питания, лекарствах и косметике]

3.16 реагент для диагностики in vitro (IVD реагент) (in vitro diagnostic reagent): Химические, биологические или иммунологические компоненты, растворы или препараты, предназначенные изготовителем для применения в качестве медицинского изделия для диагностики in vitro (см. 3.15).

[ИСО 18113-1:2009, 3.28, с изменениями - примечание 1 удалено]

3.17 тесты, разработанные лабораторией <3> (laboratory developed tests; LDTs): Тип диагностических изделий in vitro, предназначенных для клинического применения, которые разработаны, изготовлены и используются в рамках одной лаборатории.

--------------------------------

<3> В Российской Федерации применение незарегистрированных медицинских изделий для клинического применения запрещено.

 

Примечание 1 - Его часто называют "внутренним тестом".

 

[CLSI QSRLDT]

3.18 предел обнаружения (limit of detection; LOD): Значение измеренной величины, полученное с применением методики измерения, для которой вероятность ложного утверждения об отсутствии компонента в материале есть , при условии, что есть вероятность ложного утверждения о его присутствии.

Примечание 1 - Международный союз теоретической и прикладной химии (IUPAC) рекомендует и оценивать в равной мере как 0,05.

Примечание 2 - Это относится к LOD, когда тесты оценивают наличие или отсутствие нескольких анализируемых веществ (см. 3.5), а не множественный молекулярный тест (см. 3.26).

Примечание 3 - Предел обнаружения, LOD, альтернативно определяется как: 1) наименьшее количество нуклеиновой кислоты, которое можно достоверно секвенировать и отличить от ее отсутствия, как правило, в пределах установленного доверительного предела; 2) минимальная обнаруживаемая аллельная фракция в данном образце.

 

[CLSI MM09 2014]

3.19 предел обнаружения для платформы микрочипа; предел обнаружения для мультиплексной молекулярной тестовой платформы; LODP (limit of detection for microarray platform; limit of detection for multiplex molecular test platform; LODP): Наименьшее относительное количество внешнего эталона измерения (см. 3.11) (или референсного материала), которое можно последовательно обнаружить экспериментально с 95%-ным уровнем достоверности при известном (определенном/оцененном) количестве копий и/или концентрации внешнего эталона измерения (см. 3.11) (или референсного материала).

Примечание 1 - Как правило, речь идет о мультиплексном молекулярном анализе.

Примечание 2 - LODP может быть использован для оценки эксплуатационных характеристик, заменяющих предел обнаружения (см. 3.18) для мультиплексного анализа.

 

[ИСО 16578:2013, 3.9, с изменениями - добавлены примечание 1 и примечание 2]

3.20 массивное параллельное секвенирование (massive parallel sequencing): Метод, позволяющий проводить высокопроизводительное секвенирование ДНК с использованием концепции параллельной обработки очень большого числа молекул.

Примечание 1 - К примеру, но не ограничиваясь ими, технологии с миниатюризированными и распараллеленными платформами для секвенирования от тысяч до миллионов коротких считываний (~50 - 400 пар оснований) или полимеразная платформа для ДНК-секвенирования в реальном времени, позволяющая длительное считывание (средняя длина ~10 000 - 1000 пар оснований).

 

3.21 микроРНК (microRNA): Одноцепочечная РНК длиной от 17 до 25 нуклеотидов, относящаяся к посттранскрипционной регуляции экспрессии.

3.22 множественные последовательности аналита(ов) (multiple sequences of analyte(s)): Часть образца с несколькими последовательностями нуклеиновых кислот, измеренными одновременно.

3.23 мультиплексные молекулярные тесты (multiplex molecular test): Диагностические тесты in vitro, которые одновременно оценивают идентичность последовательностей и/или количество нескольких, а именно двух или более нуклеиновых кислот-мишеней, определяемых в одной серии исследования, на основе методов, таких как мультиплексная ПЦР (см. 3.25), множественная гибридизация, микрочипы и массивное параллельное секвенирование (см. 3.20).

Примечание 1 - "Мультиплекс" определяется как "тест, в котором две или более цели одновременно обнаруживают с помощью общего процесса подготовки образца, амплификации целевой последовательности или сигнала, аллельной дискриминации (см. 3.3) и коллективной интерпретации" (CLSI/MM17-A [24]).

Примечание 2 - Цели, представляющие интерес, определяют как мишени обнаружения, представляющие интерес, и исключают контрольный материал из числа целей.

 

3.24 мультиплексный молекулярный тест качества нуклеиновой кислоты (multiplex molecular test quality nucleic acid): Матрица нуклеиновой кислоты, обладающая соответствующим свойством, обеспечивающим проведение мультиплексного молекулярного теста (см. 3.23), таким как достаточная длина, количество, химическая чистота (см. 3.6), структурная целостность (см. 3.40) и наличие необходимой последовательности нуклеиновых кислот.

3.25 мультиплексная ПЦР (multiplex PCR): Метод ПЦР, который использует несколько пар праймеров, объединенных в одной реакционной смеси, для получения нескольких ампликонов одновременно.

[ИСО 16577:2016, 3.117]

3.26 мультиплексные молекулярные тесты (multivariable molecular test): Молекулярные тесты, которые объединяют значения нескольких переменных с помощью функции интерпретации для получения единого, специфичного для пациента результата, включая "классификацию", "оценку" и/или "индекс".

Примечание 1 - Это обычно основано на платформе мультиплексных молекулярных тестов.

Примечание 2 - Это предназначено для использования в диагностике заболеваний или других состояний, а также в лечении, снижении осложнений или профилактике заболеваний.

Примечание 3 - Термин "мультиплексные", используемый в статистике, подразумевает оценку нескольких результатов, а не использование нескольких переменных для оценки одного результата.

 

3.27 патоген (pathogen): Инфекционный агент, вызывающий заболевания.

Примечание 1 - Патоген включает в себя некоторые вирусы, вироиды, прионы, бактерии, грибы или паразитов.

 

[ИСО 15714:2019, 3.1.2, с изменениями]

3.28 качество ДНК, необходимое для проведения ПЦР (PCR quality DNA): Матрица ДНК достаточной длины, количества, химической чистоты (см. 3.6) и структурной целостности (см. 3.40) для амплификации методом ПЦР.

[ИСО 24276:2006, 3.2.3, с изменениями - добавлено слово "количество"]

3.29 преаналитический этап; процедуры перед исследованием (preanalytical phase; preexamination procedures): Процедуры, которые начинаются в хронологическом порядке: назначение клиницистом исследования, включение исследования в заявку, подготовка пациента к исследованию, взятие первичной пробы, транспортирование ее в лабораторию и перемещение внутри лаборатории, выделение аналита - и заканчиваются началом аналитического исследования.

[ИСО 15189:2012, 3.15, с изменениями - добавлены слова "выделение аналита"]

3.30 первичная проба; образец (primary sample; specimen) <1>: Отдельная порция биологической жидкости или тканей, взятая для исследования, изучения или анализа одной или нескольких величин или свойств, которые предполагается приписать целому.

--------------------------------

<1> В Российской Федерации для характеристики биологических жидкостей используют термин "первичная проба (проба)", для характеристики биологических тканей - термин "образец (часть образца)".

 

Примечание 1 - Рабочая группа по глобальной гармонизации (GHTF) использует термин "образец" в руководящих документах по гармонизации, обозначая пробу биологического происхождения, предназначенную для исследования в медицинской лаборатории.

Примечание 2 - В некоторых документах ИСО и СЕН "образец" определен как "биологическая проба, взятая из тела человека".

Примечание 3 - В некоторых странах термин "образец" используют вместо первичной пробы (или ее порции), которая является пробой, подготовленной для транспортирования в лабораторию (или получаемую лабораторией) и предназначенной для исследования.

 

[ИСО 15189:2012, 3.16]

3.31 диапазон уверенного сигнала (range of reliable signal): Способность (в пределах заданного диапазона) представлять результаты, прямо пропорциональные концентрации и/или числу копий внешнего стандарта (см. 3.11) (или референсного материала).

Примечание 1 - Это используется в основном для количественных, но не качественных тестов.

Примечание 2 - Также используется линейный диапазон или аналитический измеримый диапазон.

 

[ИСО 16578:2013, 3.9, с изменениями - добавлены примечание 1 и примечание 2]

3.32 диапазон, включаемый в отчетность (reportable range): Область генома, в которой последовательность приемлемого качества может быть получена в ходе лабораторного исследования.

Примечание 1 - Отчетный диапазон также определяется как "диапазон тестовых значений, в течение которого связь между измерительным откликом прибора, комплекта или системы обоснована" (US CFR 493).

 

3.33 референсный диапазон (reference range): Диапазон вариаций последовательностей, который ожидается обнаружить в биологической референтной популяции.

3.34 обратная транскрипция; ОТ (RT; reverse transcription): Синтез ДНК с матрицы РНК с использованием фермента обратной транскриптазы в сочетании с ОТ-праймером в присутствии дезоксирибонуклеотидтрифосфатов.

[ИСО 22174:2005, 3.3.1]

3.35 ОТ-ПЦР (RT reverse transcription): Метод, состоящий из двух реакций: обратной транскрипции (ОТ) РНК в ДНК и последующей ПЦР.

[ИСО 22174:2005, 3.4.2]

3.36 качество РНК для ОТ-ПЦР (RT-PCR quality RNA): Матрица РНК, длина и количество которой достаточны для проведения реакции обратной транскрипции (см. 3.34) и ПЦР.

[ИСО 22174:2005, 3.2.4, с изменениями]

3.37 проба (sample): Одна или несколько частей (порций), которые взяты из первичной пробы (образца).

[ИСО 15189:2012, 3.24, с изменениями - пример удален]

3.38 стабильность (stability): Способность медицинского изделия IVD (см. 3.15) сохранять свои эксплуатационные характеристики в определенных пределах в течение промежутка времени и условиях, установленных изготовителем.

Примечание 1 - Стабильность применяется к:

- реагентам IVD (см. 3.16): калибраторы и регуляторы при хранении, транспортировании и использовании в условиях, указанных изготовителем;

- лиофилизированным материалам после восстановления, рабочим растворам, материалам после открытия запечатанной упаковки в том случае, если они приготовлены, использовались и хранились в соответствии с инструкциями изготовителя по применению.

Примечание 2 - Стабильность реагента IVD (см. 3.16) или измерительной системы обычно определяется относительно времени:

- длительности временного интервала, в течение которого метрологическое свойство изменилось в пределах установленной величины;

- изменения свойств в течение установленного интервала времени.

 

[ИСО 18113-1:2009, 3.68, с изменениями - слова "Измерительные приборы или измерительные системы после калибровки" в примечании 1 и примечании 3 исключены]

3.39 стабильность образца (specimen stability): Способность образца сохранять установленные характеристики качества при длительном хранении в заданных условиях.

[ИСО 23833:2013, 5.5.10, с изменениями - текст "изменения химического состава при электронной бомбардировке, т.е. сопротивление изменению интенсивности соответствующих характерных рентгеновских лучей, наблюдаемое в течение времени воздействия электронного пучка на образец" заменен на "качества при длительном хранении"]

3.40 устойчивость структуры (structural integrity): Степень сохранности нуклеиновой кислоты, отражающей исходное состояние.

3.41 валидация (validation): Подтверждение выполнения требований, необходимых для конкретного использования или применения, посредством представления объективных свидетельств.

Примечание - Термин "валидирован" используют для обозначения соответствующего статуса.

 

[ИСО 9000:2015, 3.8.13, с изменениями - примечание 1, примечание 3 удалены]

3.42 верификация (verification): Подтверждение посредством представления объективных свидетельств, что установленные требования были выполнены.

Примечание 1 - Термин "верифицировано" используется для обозначения соответствующего статуса.

Примечание 2 - Верификация может включать такие действия, как:

- выполнение альтернативных расчетов,

- сравнение новой проектной спецификации с аналогичной проверенной проектной спецификацией,

- проведение испытаний и демонстраций, а также

- рассмотрение документов до их выдачи.

 

[ИСО 9000:2015, 3.8.13, с изменениями - примечание 1 и примечание 3 удалены]